Tugas utama Sekolah Kedoktoran adalah untuk menyediakan program pendidikan dalam PhD dalam Kejuruteraan Senibina dengan standard yang tinggi selaras dengan keperluan sistem Bologna kepada arkitek terkemuka dengan ijazah MSc atau MA, serta kepada mereka yang mempunyai MA atau Ijazah MSc dalam bidang berkaitan seni bina.

Program Doktor Seni Liberal (DLA) dalam Seni Bina Sekolah Kedoktoran merangkumi program seni bina dan seni bina bandar yang berkaitan dengan pelbagai aspek perancangan (seni bina ruang sosial, perancangan dan reka bentuk seni bina, perancangan persekitaran pengeluaran, perancangan persekitaran kediaman, perancangan penempatan)

Struktur PhD dalam Sains Perubatan Antara Disiplin Fakulti Perubatan adalah serupa dengan kebanyakan universiti Eropah dan Amerika. Ijazah kedoktoran (PhD), sebagai kelayakan tertinggi yang boleh dicapai di universiti, dianugerahkan oleh Universiti Pécs kepada mereka yang telah memberikan bukti telah memperoleh kemahiran praktikal dan pengetahuan teori yang mencukupi untuk menjalankan penyelidikan saintifik secara bebas.

Struktur PhD dalam Neurosains Klinikal Fakulti Perubatan adalah serupa dengan kebanyakan universiti Eropah dan Amerika. Ijazah kedoktoran (PhD), sebagai kelayakan tertinggi yang boleh dicapai di universiti, dianugerahkan oleh Universiti Pécs kepada mereka yang telah memberikan bukti memperoleh kemahiran praktikal dan pengetahuan teori yang mencukupi untuk menjalankan penyelidikan saintifik secara bebas.

Sekolah Kedoktoran Biologi dan Spotbiologi menyediakan PhD dalam Biologi dalam pelbagai bidang biologi dan sukanbiologi termasuk genetik, mikrobiologi, biologi tumbuhan, ekologi, biologi kawal selia, kecergasan, tekanan, sukan dan sistem imun. Makmal yang serba lengkap boleh didapati di jabatan biologi dan di Pusat Penyelidikan Szentágothai UP, serta di Institut Limnologi Balaton. Melalui hubungan antarabangsa kami memberi peluang kepada pelajar PhD kami untuk bergerak.

Sekolah Kedoktoran PhD dalam Fizik merangkumi bidang yang menjadi subjek penyelidikan di Institut Fizik; iaitu, fizik laser, termasuk penyelidikan laser THz dan sinar-X, optik tak linear, penjanaan denyutan laser ultrashort, pecutan zarah berasaskan laser, informatika kuantum, fizik atom dan molekul teoretikal. Penyelidikan terkemuka dunia mengenai denyutan THz bertenaga tinggi dan aplikasinya mempunyai tradisi yang kukuh di Institut. Terdapat kerjasama rapat antara sekolah kedoktoran dan tiga institut Akademi Sains Hungary: kedua-dua Institut Fizik Keadaan Pepejal dan Institut Fizik Zarah dan Nuklear Pusat Penyelidikan Wigner, dan Institut Fizik Teknikal dan Sains Bahan, seterusnya institut Extreme Light Infrastructure (ELI-ALPS) di Szeged, serta beberapa kolaborator saintifik antarabangsa dan rakan industri tempatan.\n Pelajar akan dapat mensintesis kajian teori dan empirikal, menjalankan penyelidikan mereka sendiri, dan membentangkannya secara lisan dan bertulis.

Sekolah Kedoktoran PhD dalam Sains Bumi menawarkan program latihan dan penyelidikan selama empat tahun dalam pelbagai bidang geografi, geologi dan meteorologi. Pelajar boleh memilih daripada pelbagai pilihan topik penyelidikan daripada tiga subprogram geografi Fizikal, geologi dan meteorologi; Geografi manusia; Geopolitik, Geoekonomi, dan geografi politik. Pelajar cemerlang boleh memperoleh Ph.D. ijazah selepas menamatkan pengajian dan aktiviti penyelidikan mereka. Program ini bermula pada tahun 1994 dan sejak itu lebih daripada 100 penyelidik telah menerima Ph.D mereka. ijazah dan menyertai rangkaian alumni Sekolah Kedoktoran.

Sekolah Kedoktoran PhD dalam Kimia menawarkan program latihan dan penyelidikan selama empat tahun dalam pelbagai bidang dalam sains kimia, Kimia Analitik, Kimia Bioorganik, Pemangkin Homogen, Kimia Sebatian Koordinasi, Elektrokimia, Kimia Organik Sintetik, Kimia Teori, Alam Sekitar Kimia, Biokimia, dan Sains Pemisahan. Program kimia bermula pada tahun 1993 dan sejak itu pelajar mempunyai akses kepada semua teknik moden dan boleh mengambil bahagian dalam program penyelidikan saintifik antarabangsa, yang membawa pelajar cemerlang memperoleh Ph.D. ijazah apabila memenuhi keperluan pengajian mereka.

Sekolah Kedoktoran Biologi dan Spotbiologi menyediakan PhD dalam Biologi dan Biologi Sukan dalam pelbagai bidang biologi dan biologi sukan termasuk genetik, mikrobiologi, biologi tumbuhan, ekologi, biologi kawal selia, kecergasan, tekanan, sukan dan sistem imun. Makmal yang serba lengkap boleh didapati di jabatan biologi dan di Pusat Penyelidikan Szentágothai UP, serta di Institut Limnologi Balaton. Melalui hubungan antarabangsa, kami memberi peluang kepada Ph.D kami. mobiliti pelajar.

Fakulti Perniagaan dan Ekonomi di University of Pécs menubuhkan Ph.D Antarabangsanya. Program dalam Pembangunan Wilayah untuk profesional yang telah mengumpul beberapa tahun pengalaman dalam bidang mereka bekerja di peringkat kebangsaan, serantau dan tempatan dalam membuat keputusan atau di organisasi kumpulan pemikir. Ph.D Antarabangsa. Program dalam Pembangunan Wilayah adalah milik Sekolah Kedoktoran Dasar dan Ekonomi Serantau dan oleh itu, ia adalah program kedoktoran yang diiktiraf secara nasional di Hungary.

PhD Antarabangsa dalam Pentadbiran Perniagaan ditujukan kepada profesional dalam perniagaan atau pentadbiran awam dengan beberapa tahun pengalaman dalam bidang mereka, tetapi tidak semestinya dalam penyelidikan atau pendidikan. Program ini menggabungkan kelebihan pendidikan berasaskan hubungan dan jarak jauh, berdasarkan sumbangan pakar kebangsaan dan antarabangsa yang diiktiraf. Dalam reka bentuknya, program ini menggabungkan dua tradisi antarabangsa utama dalam pendidikan kedoktoran seperti tradisi Amerika (di mana beberapa tahun pendidikan formal diperlukan untuk mendapatkan Ph.D.) dan tradisi Eropah (dengan bilangan kelas yang biasanya terhad dan penekanan yang kuat terhadap penyelidikan disertasi bebas).